В структуре больницы имеются:

13 специализированных отделений хирургического профиля;

11 специализированных отделений терапевтического профиля;

отделение общей реанимации на 36 коек;

реабилитационный центр;

6 блоков интенсивной терапии на 42 койки в составе отделений: неврологии (6 коек), пульмонологии (6 коек), эндокринологии (6 коек), кардиологии для больных с инфарктом миокарда (12 коек), инфекции (6 коек), гематологии (6 коек);

21 лечебно-диагностических отделения;

20 подразделений - административные, хозяйственные и технические службы;

вычислительный центр;

клинико-диагностический центр, имеющий в своем составе: клинико-консультативный отдел, отдел лучевой диагностики, отделение эндоскопической диагностики, отдел функциональной диагностики, медико-генетический центр, клинико-диагностическую лабораторию, отделение специализированной диспансеризации; 

врачебный здравпункт в здании администрации области.

В составе больницы действует отделение экстренной и планово-консультативной медицинской помощи, Центр медицины катастроф.

На базе больницы для врачей области проводятся выездные циклы повышения квалификации: по актуальным вопросам абдоминальной хирургии, травматологии-ортопедии, современным аспектам отоларингологии, актуальным вопросам терапии, неврологии, инфекционных болезней, клинико-экспертной работы, клинической фармакологии.

С 2003 года выездные циклы повышения квалификации проводятся и в дистанционной форме с применением телемедицинских технологий, проводятся телемедицинские консультации пациентов больницы со специалистами ведущих институтов Москвы.

На базе больницы в целях повышения квалификации регулярно проводятся клинические, клинико-патологоанатомические, общебольничные сестринские конференции.

С участием ведущих специалистов ММА им.И.М.Сеченова, профильных институтов г.Москвы проводятся научно-практические конференции, в т.ч. межобластные. Установилась традиция проведения таких конференций, как "Тареевские чтения", "Насоновские чтения", "Вересаевские чтения".